|
โปรติโอมิกส์เชิงเปรียบเทียบของโปรตีนของรากข้าว Oryza sativa L. ภายใต้ภาวะแล้ง |
|---|---|
| รหัสดีโอไอ | |
| Title | โปรติโอมิกส์เชิงเปรียบเทียบของโปรตีนของรากข้าว Oryza sativa L. ภายใต้ภาวะแล้ง |
| Creator | นวมินทร์ สงวนหมู่ |
| Contributor | ศุภจิตรา ชัชวาลย์, สิทธิรักษ์ รอยตระกูล |
| Publisher | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย |
| Publication Year | 2556 |
| Keyword | ข้าว |
| Abstract | งานวิจัยนี้เป็นการศึกษาโปรติโอมิกส์เชิงเปรียบเทียบของรากข้าวที่อยู่ภายใต้ภาวะแล้งในข้าวสองสายพันธุ์ที่มีพื้นฐานทางพันธุกรรมใกล้เคียงกัน คือข้าวสายพันธุ์เหลืองประทิว 123 (LPT123) และข้าวสายพันธุ์กลายทนแล้ง เหลืองประทิว 123-TC171 (LPT123-TC171) เมื่อทำการศึกษาแบบรูปของโปรตีนที่ได้จากรากของต้นกล้าข้าวอายุหนึ่งเดือนได้รับภาวะแล้งจากการเลี้ยงในสารละลายธาตุอาหารที่มีการเติม polyethylene glycol 6000 (PEG6000) ความเข้มข้น 10 % เป็นระยะเวลา 0 2 6 และ 24 ชั่วโมง พบว่า แบบรูปการแสดงออกของโปรตีนที่ได้จากการศึกษาด้วย GeLC-MS/MS พบโปรตีนจำนวน 597 ชนิด มี 122 ชนิดในข้าว LPT123 และ LPT123-TC171 ที่มีการแสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญภายใต้ภาวะแล้งเมื่อเทียบกับภาวะปกติ การวิเคราะห์ความแปรปรวนระหว่างกลุ่มเพื่อเปรียบเทียบเชิงปริมาณโปรตีนในข้าวทั้งสองพันธุ์/สายพันธุ์ พบว่ามีโปรตีน 96 ชนิด ที่มีแบบรูปการแสดงออกแตกต่างกัน ซึ่งโปรตีนเหล่านี้มีหน้าที่เกี่ยวข้องกับ เมแทบอลิซึม การส่งสัญญาณ กระบวนการถอดรหัสและสังเคราะห์โปรตีน โปรตีนที่มีบทบาทเกี่ยวข้องกับโครงร่างภายในเซลล์ การลำเลียงสารผ่านเข้า-ออกจากเซลล์ OsNFXL1 ถูกเลือกมาศึกษาในระดับทรานสคริปชัน เนื่องจากมีความคล้ายคลึงกับยีนที่พบใน Arabidopsis ที่มีการศึกษาแล้วว่าเป็นยีนที่มีการตอบสนองต่อภาวะแล้ง และในฐานข้อมูล rice micro-array พบว่ายีนดังกล่าวตอบสนองต่อภาวะแล้งและเค็ม ผลการศึกษา quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction ของยีน OsNFXL1 พบว่ามีการแสดงออกสอดคล้องกับโปรตีนในข้าวพันธุ์ LPT123 และ LPT123-TC171 และได้อภิปรายถึงหน้าที่ของยีนนี้ที่เป็นไปได้ในกระบวนการทนแล้ง |
| URL Website | cuir.car.chula.ac.th |
