10.14456/tjg.2013.90
การค้นหาความแตกต่างในระดับจีโนมของข้าวเจ้าหอมนิลและข้าวเจ้าหอมนิลพันธุ์กลายที่ทนทานต่อสภาวะอุณหภูมิสูงโดยใช้เทคนิค single feature polymorphism (SFP) (Identification of Genomes Differential Between Jao Hom Nin Wild Type and Mutant Line that Tolerate to H
รหัสดีโอไอ
10.14456/tjg.2013.90
Creator กุหลาบ สีสุขกลาง
Title การค้นหาความแตกต่างในระดับจีโนมของข้าวเจ้าหอมนิลและข้าวเจ้าหอมนิลพันธุ์กลายที่ทนทานต่อสภาวะอุณหภูมิสูงโดยใช้เทคนิค single feature polymorphism (SFP) (Identification of Genomes Differential Between Jao Hom Nin Wild Type and Mutant Line that Tolerate to High Temperature by Using Single Feature Polymorphism (SFP))
Publisher Genetics Society of Thailand
Publication Year 2556
Journal Title Thai Journal of Genetics
Journal Vol. S.1
Journal No. S1 (Special Issue 1)
Page no. 107
Keyword single feature polymorphism (SFP), heat tolerant, heat shock protein (Hsp)
ISSN 8578664
Abstract Techniques to find the different genes and genomes by single feature polymorphism (SFP) has been used to find the difference genomes between Jao Hom Nin wild type (JHN-wild type) and Jao Hom Nin mutant line M9962 (M6) that tolerance to high temperatures at 40-45 degree celsius. The results showed that this technique can find different SFP in the genotype precisely. The polymorphism have been identified in 1,300 different genes (1,330 probes), throughout every chromosome with the level of confidence at P < 0.01 and a false discovery rate (FDR) of 33 percentage; however, the most significant difference are found in chromosome 4 (17.8%). When these loci were further analyzed in RiceChip database (http://www.ricechip.org/), it was expected that 8 genes in Heat Shock Protein (Hsps) family, including LOC_Os06g06490 (Os.11376.1.S1_at), LOC_Os10g07210 (Os.18511.1.S1_at), LOC_Os08g38300(OsAffx.29587.1.S1_s_at), LOC_Os06g13060 (OsAffx.4821.1.S1_at), LOC_Os06g11440 (Os.7473.1.S1_at),LOC_Os10g07200 (Os.14575.1.S1_a_at), LOC_Os12g38180 (Os.38164.1.S2_at) and LOC_Os01g32870(OsAffx.11289.1.S1_x_at), are involved in the control of the rice mutant tolerance to high temperatures Thus, SFP technique can be used to discover polymorphism between the genomes effectively.
THAI JOURNAL OF GENETICS

บรรณานุกรม

EndNote

APA

Chicago

MLA

ดิจิตอลไฟล์

Digital File
DOI Smart-Search
สวัสดีค่ะ ยินดีให้บริการสอบถาม และสืบค้นข้อมูลตัวระบุวัตถุดิจิทัล (ดีโอไอ) สำนักการวิจัยแห่งชาติ (วช.) ค่ะ