|
อาร์เอ็นเอสายคู่ใน Trichoderma sp. สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย |
|---|---|
| รหัสดีโอไอ | |
| Title | อาร์เอ็นเอสายคู่ใน Trichoderma sp. สายพันธุ์ที่แยกได้ในประเทศไทย |
| Creator | บุณยฤทธิ์ จันทวิมล |
| Contributor | พงศ์ธาริน โล่ห์ตระกูล |
| Publisher | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย |
| Publication Year | 2554 |
| Keyword | อาร์เอ็นเอสายคู่, เชื้อรา -- ไทย, ไตรโคเดอร์มา, Double-stranded RNA, Trichoderma, Fungi -- Thailand |
| Abstract | ผลการตรวจสอบ double-stranded RNA (dsRNA) ในรา Trichoderma จำนวน 96 ไอโซเลต ที่คัดแยกจาก 13 จังหวัดในประเทศไทย พบ dsRNA ใน 7 ไอโซเลต (7%) ได้แก่ Trichoderma sp. Cbi3.1.1 T. harzianum Cbi3.2.2 T. reesei Cbi3.3.1 Trichoderma sp. Cpn1.1.1 Trichoderma sp. Pbn1.1.5 T. virens Plk1.1.9 และ Trichoderma sp. Ubn1.1.3 ลักษณะ dsRNA ที่พบในราแต่ละไอโซเลตมีจำนวนตั้งแต่ 1-10 แถบ และมีขนาด โดยประมาณ 1.25–21.9 kb จากนั้น ได้เลือก dsRNA จาก T. reesei Cbi3.3.1 ซึ่งมีจำนวน 3 แถบ ขนาดประมาณ 2.06 – 2.26 kb ไปสังเคราะห์ cDNA โคลน และศึกษาลำดับนิวคลีโอ ไทด์ พบว่าลำดับนิวคลีโอไทด์บางส่วนของ dsRNA จาก cDNA โคลน c88 c101 และ c171 สามารถถอดรหัสเป็นโปรตีนซึ่งมีความคล้ายคลึงกับ putative RNA dependent RNA polymerases และ putative capsid proteins ของไวรัสในสกุล Partitivirus ผลการวิเคราะห์ ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการยืนยันว่า dsRNA จาก T. reesei Cbi3.3.1 มีความใกล้ชิดกับ ไวรัสสกุล Partitivirus การศึกษาเปรียบเทียบระหว่างโคโลนีเซลล์เดี่ยวที่มีและไม่มี dsRNA ของ T. reesei Cbi3.3.1 พบว่า dsRNA มีผลต่อการเติบโตที่แตกต่างกันเมื่อทำการเลี้ยงในอาหาร Corn meal dextrose agar ที่อุณหภูมิ 30°C และ 40°C และพบการสร้างสปอร์ที่ ต่างกันภายหลังการเลี้ยงเป็นเวลา 14 วัน ในขณะที่การเลี้ยงในอาหาร Synthetic low nutrient agar พบความแตกต่างที่อุณหภูมิ 15°C เท่านั้น สำหรับการผลิตเอนไซม์ endoglucanase ไม่พบความแตกต่างของค่าเฉลี่ยของแอคติวิตีและแอคติวิตีจำเพาะของ เอนไซม์ในโคโลนีทั้งสองกลุ่ม แต่พบว่ากลุ่มของโคโลนีที่ไม่มี dsRNA มีค่าเฉลี่ยของปริมาณ โปรตีนใน crude enzyme ที่สูงกว่าอย่างมีนัยสำคัญ |
| URL Website | cuir.car.chula.ac.th |
